15 июля 1976 года власти Воронежа приняли решение включить поселок Шилово в состав города. С этого момента он стал микрорайоном столицы Черноземья.
Освоение этой территории началось еще в XVIII веке. В 1772 году в Шилово возвели первую церковь, которую назвали в честь Иоанна Богослова. В те годы наличие церкви означало, что поселение уже считалось серьезным населенным пунктом.
Активная застройка шиловских земель началась в конце XIX столетия благодаря развитию железнодорожного транспорта. Появление железной дороги Москва-Донбасс сделало эту территорию перспективной для строительства предприятий. Свое название поселение, вероятно, получило от фамилии первого владельца земель и купца Никифора Шилова, который построил здесь завод по производству сельскохозяйственных машин.
Во времена Советского Союза населенный пункт продолжил расти и стал важным промышленным узлом области. Здесь появились новые предприятия: ремонтно-механический завод, элеватор, деревообрабатывающий комбинат. Одновременно увеличивалась численность населения, что потребовало масштабного жилищного строительства.
Развитие промышленности и рост числа жителей привели к тому, что поселок Шилово постепенно слился с соседним Воронежем. Его промышленные зоны и жилые кварталы стали неотъемлемой частью городской жизни.
В 1983 в бывшем поселке началось строительство атомной станции, всех жителей выселили. Но в 1990-м воронежцы на референдуме проголосовали против строительства станции. Несколько десятилетий назад на этой территории планировалось строительство атомной станции, но граждане сказали свое «нет» на референдуме.